Dit is een lijst van de eilanden en eilandengroepen in Indonesië.
A Adi Adonara Alor Alorarchipel Ambon Ara Aru-eilanden Asilulu
B Bacan Bali Banda-eilanden Banda Besar Bangka Barat Daya-eilanden Batanta Batam Batjan Bengkalis Biak Billiton Bintam Bisa Boano Borneo Buaya Buru
C Celebes Ceram
D Damar Djampea Dolak Duizendeilanden
E Enggano
F Flores
G Gebe Gorom (Gorong) Gili trawangan Gili Meno Gili Air
H Halmahera Haruku
J Japen Java
K Kai Besar Kai Ketjil Kalimantan, zie ook Borneo Karakelong Karimun Kei-eilanden Kepa Kepulauan Seribu Kobroor Kofiau Komodo
L Lakor Lembeh Lerat Leti-eilanden Lifamatola Lomblen Lombok
M Machian Madura Manawaka Mandioli Mangole Mentawai-eilanden Misool Molukken Morotai Maluku
N Natuna-eilanden Ndao Ngelengele-Besar Nias Nieuw-Guinea Noord-Pagai Numfor Num
O Obi (Javazee) Obi (Molukken) Owi
P Palu Pantar Panjang Pasumpahan Pura
R Raijua Rani Rau Riau-archipel Romang Rondo Roti
S Salawati Salebabu Sangihe-eilanden Sanana Sangeang Saparua Șelaru Seram Seram Rei Siau Siberut Simeulue Sipora Solor Su Mios Sulawesi Sumatra Sumba Sumbawa Supiori
T Talaudeilanden Taliabu Tanimbar-eilanden Tereweng Ternate Tidore Timor Tioor
W Waigeo Wamar Watubela Wetar Wokam Wuliaru
Y Yamdena
Z Zuid-Pagai
Indonesische eilanden Eilanden